Les présidents des commissions sont des représentants CASI. Les autres membres sont des cheminots du périmètre CASI désignés par les organisations syndicales majoritaires.
Le CASI de Nantes a fait le choix de conserver la représentativité issue des élections professionnelles. Chaque commission est donc composée de : 3 membres CGT, 2 membres SUD et 1 membre UNSA.
Le secrétaire assiste aux commissions, mais ne participe pas au vote. Chaque commission présente ensuite ses comptes-rendus au bureau du CASI pour validation de leurs conclusions.